7月19日 "總統府"說明："總統"因島內外公共聯系及民間"外交"工作需要，交由"總統府"機要室委托專人進行必要之工作，其所需之相關費用皆依據規定據領結報，無所謂貪瀆不法情事。
7月28日 "總統府"說明：對于外界質疑的發票問題，希望民眾了解并尊重"元首"推動"國務機要"工作的必要性及復雜性。
7月31日 "總統府"說明：陳水扁相關報支皆依程序辦理，絕無徇私、中飽私囊情事。
8月7日 陳水扁在"總統府"接受陳瑞仁密訊。
8月12日 陳水扁稱"國務機要費"使用，是轉型期后遺癥，在改革過程中，不能說過去不可以、過去不對的，就可以原諒，而現在的不可以，就說成是特權、是貪瀆，不能有雙重標準。
8月20日 吳淑珍在玉山"官邸"接受陳瑞仁密訊。
9月5日 陳水扁稱："國安"密帳、"總統"的私房錢全部繳庫后，"機密費"不夠，必須要動到其他的"國務機要費"，所以有很多我們不得不的便宜措施。這一部分我們用其他的單據、發票把它領出來，全部用在公的方面，絕對沒有納入到私人的口袋。
10月2日 "總統府副秘書長"卓榮泰表示："國務機要費"核銷單據中，確實有購買童書及男表發票，但沒有李慧芬對外所稱購買女性內衣的發票。"發票"不是問題的重點，重點在于錢的流向絕未中飽私囊。"總統府"自今年9月起取消以往用領據支領"國務機要費"半數的作法。
10月5日 "總統府"說明："總統"只有提供單據，并未提出所謂"工作人員"名單給檢調單位。
10月23日 "國安會秘書長"邱義仁在"立法院"表示，只要是陳水扁或是其夫人吳淑珍涉及弊案，"總統"就會下臺負責。
10月24日 "行政院長"蘇貞昌答詢時表示，如果政治人物涉案，就應該下臺，"總統"或其夫人也不例外。
(資料來源：臺灣聯合新聞網）
