研究太湖污染多年的河海大學教授劉凌介紹，目前太湖水底泥中，40%的磷是因為農業面源污染，另外三分之一是生活污水，工業污染只占了很小的一部分。
而在太湖周邊的圍欄養殖，也對太湖水質有所損害。太湖水產品豐富，飼養投放的餌料成為水中有害藻類生長的肥料,加重了水質的富營養化。
目前，太湖的富營養化已呈積重難返之勢，甚至達到了單個的、短期的、片面的措施根本無力回天的程度。
治藻—治污：政府治理難題
數天內，無錫市政府采取了一系列措施，自來水廠水質強化處理、打撈藍藻、調水引流、人工增雨對策等。
“但這都只是短期應急的辦法，不能把這些作為根本解決問題的方式。”河海大學教授劉凌說。
農林局目前調集了一批藍藻打撈船，在沿湖地區進行打撈，但是人工作業，而且必須在藍藻數量達到一定程度之后才能進行，所以這只是治標之法。
近年來，“引江濟太”被認為是太湖治理的重要措施——太湖水質在靠近蘇州的東太湖和靠近無錫的西太湖有很大不同，東太湖水質明顯優于西太湖，主要是由于望虞河的調水作用——因此有專家認為，長江水入西太湖對改善太湖水質作用極大。
但實際上，但隨著長江水質逐漸惡化，部分水質指標已經與太湖非常接近，有的指標(如磷)已超過太湖，長江作為“引江濟太”清潔水的來源將難以為繼。
從此意義上說，“引江濟太”只能作為臨時應急措施，不能作為一種常態方法使用。
另外一種已經采取的治藻的方式是進行太湖生態修復工程。
2004年，國家和地方政府投入了近20億資金，對太湖的五里湖地區進行了重點治理，整改湖濱帶，清理了一些廢棄魚塘；采用了梅梁灣水源地水質改善技術、河網區面源污染控制成套技術、重污染水體底泥環保疏浚與生態重建三大技術。
“確實有了很好的效果，五里湖的水質也的確有所改善。”劉凌肯定了這種方式，也認為在梅梁湖等主要污染湖區都可以采取這種方式，進行修護。
但是，劉凌認為，生態修護必須要有個前提——首先控源。這也是很多學者一致的意見，如果污染源頭不控制住，“邊治理、邊污染”最終還是看不到什么效果。
從1995年起，太湖就被列入國家“三河三湖”水污染防治的重點，10年的治理中，各級政府都投入了大量資金，建設了大批工程。10年間，僅圍繞國家太湖水污染防治“十五”計劃的落實，江蘇省就投入了80多億元，建設了包括77座污水處理廠在內的9大類共176項水環境綜合整治工程。
然而所有的努力，都被污染的加劇所淹沒。太湖流域經濟的繁榮，創造了占國內生產總值的10%、財政收入16%的奇跡。但由于“重經濟發展、輕環境保護”，太湖湖泊生態系統結構遭受空前破壞，連續多年發生了湖泊萎縮、功能衰退、水質污染、濕地減少等現象。有資料顯示，因太湖整個水質污染造成的損失每年大約在50億元左右。
據統計，2005年太湖治理一期總投資約人民幣100億元。即將開始的太湖治理二期工程預算投資甚至達到了1000億元。
而真正把太湖恢復到魚肥水美將付出的代價可能是更為巨大的。曾有日本專家經過兩年調查，認為太湖水質要在10年內恢復到上世紀80年代初的水平，最少要投入2251.5億元。★
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