在三峽工程開工之前，曾經歷了長達近40年的科研與論證，其中關于水庫的生態與環境就是科研與爭論的重要內容之一。
為了確保三峽庫區的生態安全，國務院在2001年批準實施了《三峽庫區及其上游水污染防治規劃》，從2001年起到2010年,國家共安排392.2億元國債資金用于三峽庫區及其上游的污染治理，目前，三峽庫區城鎮已建成58座污水處理廠和41個垃圾處理場，同時關停破產了1500多家會造成污染的工礦企業。
2006年三峽大壩全線建成并實現了初期156米水位蓄水的目標，那么大壩建成這一年來三峽庫區的生態環境如何？ 當年關于三峽庫區可能出現的生態影響，如今在現實中又有了怎樣的答案呢？
李小萌：今天我們也是面對事實，用事實說話，我們整理了一下三大方面跟三峽工程有關的問題，咱們來逐個解決一下。第一個，水庫蓄水之后，水流緩慢，導致水富營養化問題出現。這個問題您來解答。
汪嘯風：您提出第一個問題，它涉及到水體的降解能力，三峽庫區的變化，從一條長江干流變成了一個河道性的水庫，這個水庫形成以后，它有增加降解能力的可能，水體加大以后，降解能力自然會增大，這也是有科學依據的。同時它也會造成流速減緩和上下水體的交換減弱，這樣也可能對像富營養化這些情況產生加速的一些因素，但現在解決問題有一個關鍵措施是很有效的，就是成庫以后，在庫區截污方面采取了重大的措施，這是原來所沒有的，就是把污染源截流在水庫之外，而在地面進行處理，這樣對于富營養化的問題，除了工程措施以外，還有生物等等措施，它是可以解決好的。
李小萌：但同時我們也看到一些報道說，長江的一些支流出現水華的現象比較嚴重，這個問題我們請國務院三峽辦水庫司副處長王殿常博士解釋一下。
王殿常：關于三峽庫區支流富營養化的問題，是因為整個三峽庫區的支流污染負荷背景值本來就很高，三峽蓄水以后，因為受到回水的頂托，在合適的氣候條件下，局部的水域藻類會大量繁殖，就是說在三峽部分支流的局部水域短時間內會出現富營養化現象，主要就是表現為水華，這個問題在三峽的論證和可行性研究階段都已經預測到了，現在看來這個問題是并不嚴重，只是在部分支流的局部水域短期內，主要是在春季出現。
李小萌：你說短期出現，那就是說這個短期什么時候能過去，過去之后就不再出現類似的現象了嗎？
王殿常：這個所謂的短期是指階段性的，和氣候的條件、降雨都有很大的關系，比如說在春季溫度突然升高的時候，藻類會大量繁殖，在局部水域可能會出現水華的現象，但是如果說來了一場雨，下雨以后，這個問題就會得到緩解。
李小萌：王博士講得很嚴謹，但是專業性也很強，水博先生您給我們通俗化一點解釋一下。三峽工程對于整個長江流域的水污染問題，究竟是正向的影響還是負面的影響呢？
張博庭：通俗化說，就是水庫建成不一定就要把水質變壞，也有變好的可能，什么情況下會變壞呢？就是說污染排放非常嚴重，污染排放非常嚴重，又得不到治理，這時候它在水庫里不斷地需要耗氧量非常大，沒有這么大氧，最后出現水富營養化。
李小萌：您意思就是說關鍵問題還是解決污染排放問題。
張博庭：污染排放只要小到一定程度，因為水庫水質的凈化本身還有生物進化非常有作用，比如說里面有些草類、魚類、自然生態系統，為什么人類歷史幾千年了，從來沒有哪個自然湖泊發生過富營養化，什么藍藻，這種情況根本沒有，就是因為你不排污，不是人類的這種化學污染這種污染進去，不會有這種情況，本身如果僅僅建一個水庫，其實很可能是水質變好，一般的情況應該是這樣。
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